Судя по сообщениям в багтрекере, этот BaseCamp очень криворукая поделка в плане импорта GPX и чтобы подстроиться под него, нужно будет сильно постараться. И мне кажется, более целесообразно будет cделать отдельный экспорт в BaseCamp-совместимый gpx, чем урезать существующий.
Либо, призвать к ответу разработчиков BaseCamp, чтобы они устранили это безобразие: https://forums.garmin.com/showthread.ph ... o-Basecamp